FORSKNINGSENS FÖRUTSÄTTNINGAR. I ett mångårigt projekt har nu Niclas Karlsson med kollegor kartlagt hur kolhydrater kan förändra proteiner. I samarbete med Swiss Institue of Bioinformatics (SIB) har informationen sammanställts i forskningsdatabasen Unicarb-DB.
– Vi är glada över att ha hittat en partner som ser värdet i att förmedla vår insamlade data, säger Niclas Karlsson.
Databasen nås via webben, på http://unicarb-db.expasy.org/. Niclas Karlsson är noga med att poängtera att databasen bara är ett verktyg:
– På samma sätt som en karta när man ska ut och orientera i skogen kommer forskning om proteiner och kolhydrater att ha användning av Unicarb-DB.
Frederique Lysacek från SIB instämmer med Niclas Karlsson och tillägger:
– Genom att använda datorer, bra databaser och rätt sökverktyg kan mängder av information från patientprover analyseras. DNA-forskningen har redan visat detta. Tillsammans med Unicarb-DB riktar vi nu in oss på att utveckla sökverktyg för att upptäcka kolhydratförändringar.
Sammarbetet mellan Göteborgs universitet och SIB kommer att offentliggöras under ett möte i Göteborg med forskare från hela världen.
Frederique Lysacek är en av de inbjudna talarna till konferensen 15th annual Swedish Proteomics Society (SPS) symposium and the annual meeting for the Swedish Mass Spectrometry Society (SMSS).
Frederique Lysacek presentation om hur bioinformatik kan hjälpa forskare att hitta dolda skatter bland stora mängder bioanalytiska mätningar sker måndag 21 november.
TEXT: JESSICA ÖRNROS
BILD: MIGUEL ROJAS
