CORE FACILITIES. Flera veckors sökande efter biomarkörer i cancerprover har nu kortats ner till sekunders eller på sin höjd minuters arbete. Genom ett samarbetsprojekt mellan Bioinformatics and Data Centre (BDC) och Britta Langens vid Sahlgrenska Cancer Center, har ett machine learning-program utvecklats som bland annat kan visa effekter av strålbehandling på olika vävnader samt ge indikation på om stråldoser behöver justeras. – Att identifiera biomarkörer för strålningsdosimetri med hjälp av…
Bioinformatik-stödet vid Core Facilities samlat på en gemensam enhet
ORGANISATION. Två bioinformatikenheter vid Core Facilities är sedan början av september sammanslagna till en: Bioinformatics and Data Centre. Forskare kan nu dra nytta av ett brett utbud av stöd utan att behöva vända sig till olika team. Bioinformatics and Data Centre erbjuder nya tekniker med hög kapacitet, exempelvis next-generation sequencing (NGS) och proteomik för klinisk och pre-klinisk forskning. Dessutom finns ett brett utbud av stöd inom bioinformatik och statistik tillgängligt…
Använde krisen till att utveckla online-undervisningen
UTBILDNING. Som enda studie på temat undervisning, blev Sanna Abrahamssons och Marcela Davilas artikel utvald att vara del av specialutgåvan av den ledande internationella tidskriften Bioinformatics i juli 2021. Studien utgår från studenters kursutvärderingar av online-kurser under pandemin, och föreslår en kombination av fyra inslag för att få så bra inlärningsmiljö som möjligt för online-undervisning. De fyra inslagen som enligt studien bör kombineras för att få bästa utväxling i en onlinekurs är:…
Helena Carén får Senior Investigator Award från Cancerfonden
BIDRAG. Helena Carén, gruppledare vid Sahlgrenska Cancer Center, får nu sex års lön finansierad av Cancerfonden genom tilldelningen av Senior Investigator Award. Hon utvecklar bland annat metoder, baserade på DNA-metylering, som kan användas för att diagnostisera olika typer av tumörer. Helena Carén gläds över bidraget, som ger henne ekonomisk trygghet att fokusera på forskningen de närmsta åren: – Cancerfonden ställer höga krav på den forskning som finansieras, och vi ser…
Lilla Fernströmspriset till Erik Larsson Lekholm
UTMÄRKELSER. Erik Larsson Lekholm är årets mottagare av Lilla Fernströmspriset vid Sahlgrenska akademin, eller Eric K. Fernströms pris till yngre, särskilt lovande och framgångsrika forskare som priset egentligen heter. Tidigare i år blev Erik Larsson Lekholm också utnämnd till professor i bioinformatik, med särskild inriktning mot storskalig analys av DNA och RNA. Det personliga priset på 90 000 kronor kommer lägligt, konstaterar Erik när jag träffar honom i hans rum på…