BIDRAG. Totalt beviljades 6 ansökningar ALF-medel om sammanlagt 12,4 miljoner kronor för inköp av tung utrustning för klinisk forskning under 2022. Mest medel ges för inköp av en spektral flödescytometer och en avancerad masspektrometer för högupplösande translationell- och klinisk proteomik. Förhoppningsvis kan båda dessa instrument göras tillgängliga genom Core Facilities.
Det är en rad forskare vid flera av Sahlgrenska akademins institutioner och forskningsenheter som står bakom ansökan för att köpa in en spektral flödescytometer. Instrumentet ger möjlighet att karakterisera cellers fenotyp på en högre nivå, också i en ett mycket litet prov.
– Till skillnad från vanlig flödescytometri kan detta instrument fånga hela spannet av fluoroforer, vilket innebär att vi kan använda överlappande antikroppar tillsammans, och det blir möjligt att färga in prover med uppemot femtio antikroppar på samma gång, säger Davide Angeletti och fortsätter:
– En annan fördel är att konventionella antikroppar, som används för flödescytometri, även kan användas för spektral flödescytometri. Så det finns inget behov av att köpa specialiserade reagenser.
Tillgängligt för alla
Forskarna bakom ansökan får 3,7 miljoner kronor till inköpet, som förhoppningsvis kommer placeras inom Core Facilities, så att det blir brett tillgängligt för forskare.
För Davide Angelettis grupp kommer instrumentet att vara mest användbart i pågående forskning om covid:
– Vi har begränsat och värdefullt patientmaterial, där vi just nu använder en 18-färgspanel för att studera B-celler för att maximera informationen vi kan få från varje prov. Bara detta är tekniskt utmanande, och ändå skulle vi vilja lägga till fler markörer för att få ännu mer information. Med den spektrala flödescytometern kan vi enkelt komplettera vår B-cellspanel och till och med inkludera en T-cellsfenotypningspanel från samma mängd prov. Fantastiskt!
Toppinstrument för analys av proteiner
Även Proteomics Core Facilities kommer att kunna köpa in ett toppinstrument, som innebär en uppgradering av utbudet. Carina Sihlbom är huvudsökande, och får 3,6 miljoner kronor till inköpet. Instrumentet är en Orbitrap Eclipse Tribrid masspektrometer, som med bättre selektivitet och känslighet kommer ge forskningen än mer högkvalitativa data.
– Ett av kännetecknen för enheterna inom Core Facilities är öppenhet och när denna nya analysutrustning nu placeras vid Proteomics Core Facility blir den tillgänglig för alla forskare, särskilt inom Sahlgrenska akademin och Västra Götalandsregionen, säger Carina Sihlbom, enhetschef på Proteomics Core Facility (PCF).
Forskning med spjutspets
Kvantifiering av protein har utförts i cirka 40 procent av studierna som genomförts vid enheten de senaste tre åren. Därför tror Carina att uppgraderingen av den nuvarande versionen av Orbitrap-instrumentet kommer ge resultat och vara efterfrågad.
– För att kunna driva forskningen framåt med spjutspets och publicera resultaten i high impact-tidskrifter även fortsättningsvis, är det av yttersta vikt att vi kan erbjuda analyser med de känsligaste och mest högpresterande analysinstrumenten, säger Carina.
Tillgänglig 2022
Uppgraderingen kommer exempelvis innebära att låguttryckta proteiner lättare kan identifieras. Nya massfilter kommer även ge bättre selektivitet och känslighet, vilket gör att datamatchning kan ske i realtid under analysens gång för ökat dynamiskt område och noggrannhet.
– Under senare delen av 2022 kommer instrumentet finnas installerat och forskare kan då registrera sina projekt via facilitetens webbsida efter initiala diskussioner med oss om antal prov och hur provmaterial ska samlas in, berättar Carina.
AV: CHARBEL SADER & ELIN LINDSTRÖM
Dessa tilldelas medel:
- John Paoli. Ex vivo konfokalmikroskopi för snabb pre- och intraoperativ histopatologisk bedömning av färska biologiska vävnader.
1 200 000 kronor - Helena Odenstedt Hergès. Neuromonitoring and cerebral autoregulation in critically ill patients.
1 200 000 kronor - Mihai Oltean. Normoterm leverperfusion för rekonditionering av marginella organ samt för ex-vivo studier av leverfunktionen med och utan farmakologiska interventioner/Normothermic liver perfusion for reconditioning of marginal organs and studies on liver physiology with or without pharmacologic intervention.
1 400 000 kronor - Maria Ljungberg. Icke-invasiv kartläggning av natrium-23 och fosfor-31 i hjärnan med magnetkamera.
1 300 000 kronor - Davide Angeletti. Spectral Flow Cytometer for Clinical and Translational Research. 3 700 000 kronor
- Carina Sihlbom. Orbitrap Eclipse Tribrid Masspektrometri för högupplösande translationell- och klinisk proteomik.
3 600 000 kronor
