BIDRAG. Johan Bengtsson-Palme, forskare inom Centre for Antibiotic Resistance Research (CARe), koordinerar ett internationellt forskningsprogram som ska övervaka antibiotikaresistens i miljön. Forskningsprogrammet kallas EMBARK, och har fått motsvarande 15 miljoner kronor inom det internationella samarbetet kring forskning om antimikrobiell resistens, Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance (JPI-AMR).
Projektet ska leda till ett ramverk för miljöövervakning av antibiotikaresistens.
– Idén till projektet fick jag i mitt arbete på EU-nivå kring hur vi ska tackla antibiotikaresistens i miljön och det ska bli roligt att få bidra med en viktig pusselbit i det arbetet, säger Johan Bengtsson-Palme, som är forskarassistent vid avdelningen för infektionsmedicin.
Förutom uppdraget att koordinera det internationella forskningsprogrammet inom samarbetet JPI-AMR får han drygt 3,1 miljoner kronor till sin egen del av projektet:
– Eftersom jag leder en nästan helt nystartad forskargrupp är det här anslaget naturligtvis ett jätteviktigt kvitto på att det jag gör nu och vill göra framöver håller en bra kvalitet och att idéerna har en forskningsmässig höjd. Det är också ett gyllene tillfälle att få skapa ett ännu större internationellt nätverk.
Kartlägger normala nivåer
Det främsta målet med projektet är att ta fram vad som är ”normalnivåer” för antibiotikaresistens i olika miljöer.
– Hur många resistensgener är normalt att hitta i en oförorenad sjö, i dricksvatten, i vanlig jord, i stadsmiljö och så vidare? Den här datan behövs för att kunna se om en miljö som potentiellt är förorenad avviker från det normala, men idag finns det ingen sådan systematisk information. Vi vill också jämföra denna baslinje för resistens mellan länder. Det andra stora målet i projektet är att använda denna baslinje-information för att utveckla bättre och effektivare metoder för miljöövervakning av antibiotikaresistens, berättar Johan Bengtsson-Palme, som personligen tycker det ska bli intressant att få en systematisk jämförelse av situationen när det gäller resistens inom olika länder:
– Här finns spridda skurar av data sedan tidigare, men ingen riktigt bra övergripande bild. Det ska också bli väldigt spännande att se hur bra vi kan bli på att upptäcka framtida resistenshot och inkorporera det i miljöövervakning.
Sex forskargrupper i fem länder
Förutom Johan Bengtsson-Palme vid Göteborgs universitet, som koordinerar projektet, ingår epidemiologerna Etienne Ruppé (Frankrike) och Rabaab Zahra (Pakistan), Thomas Berendonk (Tyskland) som är expert på antibiotikaresistens i vattenmiljöer samt Sofia Forslund (Tyskland) och Luis Pedro Coelho (Kina) som står för bioinformatiken och den storskaliga dataanalysen i projektet.
– Det här är ett team som har helt unika förutsättningar att tackla problemet med att övervaka antibiotikaresistens i miljön på ett effektivt sätt, konstaterar Johan Bengtsson-Palme.
Kostnadseffektiv övervakning
Det ramverk för miljöövervakning av antibiotikaresistens som projektet ska leda till ska bygga vidare på övervakningsinitiativ som redan finns, genom att projektet standardiserar olika metoder och utvecklar verktyg för att göra olika övervakningssätt jämförelsebara med varandra.
– Vi kommer också att identifiera vilka som är de mest informativa typerna av data att titta på för olika syften, vilket kommer bidra till att göra övervakningen mer kostnadseffektiv. Det i sin tur kommer vara extremt viktigt eftersom de kanske mest intressanta platserna att göra miljöövervakning av resistens på är de ställen där det finns minst resurser att tillgå, det vill säga i låginkomstländer där till exempel hygien och tillgång till rent vatten är betydligt mycket sämre än i Europa.
Att på bara tre år omsätta vetenskapliga resultat till ett bra, genomtänkt och flexibelt förslag för miljöövervakning kommer att bli utmanande.
– Man ska komma ihåg att de flesta sådana initiativ kring att samordna övervakning av antibiotikaresistens i miljön har blivit slag i luften, så här kommer vi att få kämpa lite tror jag, säger Johan Bengtsson-Palme.
- Här kan du läsa mer om EMBARK: http://antimicrobialresistance.eu
- Här kan du se en film där Johan Bengtsson-Palme berättar om projektet: https://youtu.be/KKJbd-VWFls
TEXT: ELIN LINDSTRÖM
